Przez Bagieniec przepływa potok Jabłoniec, zwany też Bagieniecką Wodą, który we wschodniej części wsi tworzy zakole i wcina się doliną przełomową przez wzgórza granitowej. W centralnym obniżeniu wsi znajduje się kilka stawów. Na największym z nich, na sztucznej granitowej wyspie stoi XVII- wieczny pałac.